A Biblioteca Central de Estudos Africanos constitui um esforço conjunto de quatro centros de investigação na área dos estudos africanos: o Centro de Estudos Africanos do Iscte-Instituto Universitário de Lisboa, agora Centro de Estudos Internacionais do Iscte-Instituto Universitário de Lisboa, o Centro de Estudos Africanos da Universidade do Porto, o Centro de Estudos sobre África e do Desenvolvimento do ISEG-UTL e o Centro de Estudos Africanos da Faculdade de Letras da Universidade de Lisboa.
A Biblioteca está instalada numa ala da Biblioteca do ISCTE-IUL e reúne cerca de 15 mil volumes. A fonte de financiamento para a fundação da BCEA foi o Projecto de Re-equipamento Científico (REEQ/26/SOA/2005) da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia, entidade gestora e financiadora do mesmo projecto.
Actualmente, a Biblioteca é financiada pela FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia, no ambito do projeto de Financiamento Programático com a referencia UIDP/03122/2020.